深圳湾实验室系统与物理生物学研究所 本次发布的数据集 DD-13M, DD-13M数据集是一个专注于药物-蛋白质解离过程的轨迹数据库。该数据集基于PDBbind+ koff数据集的680个配体-蛋白质3D结构,通过分子动力学模拟生成了26,612个解离轨迹,包含约1,278万个复合物构象框架。该数据集的创建利用了元动力学增强采样算法,克服了传统分子动力学模拟在药物-蛋白质解离动力学研究中的局限性。DD-13M数据集的发布为计算结构生物学带来了重大突破,预期将在药物-蛋白质相互作用的人工智能研究中得到广泛应用。
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