英国埃克塞特大学 发布 OmniGenBench 数据集, 应用在 基因组学、基准测试 领域

英国埃克塞特大学 本次发布的数据集 OmniGenBench, OmniGenBench是一个模块化的基准测试平台，旨在为可重复的基因组基础模型（GFM）评估提供一个统一的框架。它提供集中访问123个精心策划的基因组数据集，以及清晰的文档和标准化格式。该平台简化了数据在不同研究和训练任务中的重用，并确保了不同研究之间的一致性。它还促进了社区共享基因组数据集。OmniGenBench的模型模块提供了一个标准化的模型中心，具有统一的包装器和应用程序编程接口（API），集成了31个GFM，简化了不同GFM的集成。基准模块提供了全面的自动基准测试套件，涵盖多种基因组任务，包括123+个数据集和58+个指标。最后，解释模块集成了三个标准化的解释工具，以便研究人员可以常规地进行可重复的分析，例如基序发现和特征归因映射。

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