华南师范大学 本次发布的数据集 TextOmics, TextOmics是一个开创性的基准数据集,它建立了组学表达与分子文本描述之间的一对一对应关系。TextOmics提供了一种异构数据集,通过表示对齐来促进分子生成。该数据集包含了反映生物环境、传递语义知识和编码化学结构的SELFIES表示等三种异构数据。SELFIES作为一种桥梁表示,有效地将组学表达和文本描述联系起来。TextOmics数据集的构建过程涉及将分子暴露于特定的细胞环境,以获得相应的组学表达,并通过BioT5将SELFIES表示转换为相应的文本描述。TextOmics旨在解决药物发现中缺乏异构数据和统一框架的问题,用于生成具有治疗潜力的类似命中分子。
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