哥伦比亚安第斯大学 本次发布的数据集 Expanded Standardized Collection for Antimicrobial Peptide Evaluation (ESCAPE), ESCAPE数据集是一个包含超过8万个肽的全面数据集,这些肽来自27个经过验证的公共数据库。该数据集将抗微生物肽与负序列分开,并将它们的函数注释纳入到一个生物上连贯的多标签层次结构中,捕捉跨抗菌、抗真菌、抗病毒和抗寄生虫类别的活动。ESCAPE数据集的创建旨在为AI驱动的抗微生物肽研究提供一个全面且可重复的评估框架。数据集的构建过程包括从公共数据库收集数据、预处理和验证序列、标准化功能注释以及将数据集划分为交叉验证和测试集。该数据集适用于解决抗微生物耐药性(AMR)问题,旨在通过加速抗微生物肽的发现来寻找替代抗生素的解决方案。
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